Syaikhina KH. Muhammad Hudun Abdul Ghoni dilahirkan pada masa penjajahan Belanda dari pasangan KH. Abdul Ghoni Umar dan Ibu Kiswati binti KH. Abdul Syukur. Tepatnya pada hari Senin Wage tanggal 24 Romadlon 1353 H/31 Desember 1934 M di Dukuh Sendang Jambu Mlonggo Jepara.
Pada masa kecilnya beliau diberi nama HUDUN. Beliau adalah putra terakhir dari sepuluh bersaudara, yaitu Mudzakkir, Mas'udah, Mughniyah, Mujabatun, Syarifatun, M. Gholib, Muhammadun, Ya'qub, dan Abdul Qoyyum. Selain itu, beliau juga masih mempunyai saudara seayah yaitu Mahfudloh, dan Hasbullah dari Ibu yang bernama (Hindun) serta Maskanah dari Ibu yang bernama (Tarminah).
Pada masa kecil, beliau tinggal di Desa Jambu selama 7 tahun. Kemudian pada masa penjajahan Jepang, tepatnya tahun 1941 M beliau ikut bersama orang tua pindah ke Desa Banyumanis Keling Jepara. Di antara saudara-saudara yang ikut bersama beliau adalah Syarifatun Mujabatun, Muhammadun, Ya'qub dan Abdul Qoyyum. Oleh orang tuanya beliau dimasukkan ke sebuah pendidikan Sekolah Rakyat (SR) di Desa Banyumanis. Beliau mengenyam pendidikan di SR tersebut hanya sampai kelas tiga (1947-1949 M), hal itu disebabkan karena sekolah tersebut hanya menyelenggarakan kelas satu sampai kelas tiga. Demi menyelesaikan jenjang pendidikan SR hingga lulus kelas enam, beliau pindah ke SR yang berada di Desa Tulakan. Untuk sampai pada sekolah tersebut beliau harus berjalan kaki dengan menempuh jarak ± 8 Km. Keadaan seperti itu beliau lalui hingga tamat kelas enam SR (1949-1952). Semua itu beliau lakukan dengan rasa semangat dan senang hati demi meraih ilmu dan cita-cita.
Setelah beliau menamatkan Sekolah Rakyat (SR) pada tahun 1952 M, beliau langsung melanjutkan belajar di Madrasah Ibtidaiyah (MI) yang berada di Desa Kelet. Walaupun jarak antara Desa Banyumanis-Kelet terhitung jauh (±16 Km). Namun, tidak melemahkan dan menyurutkan semangat beliau untuk menuntut ilmu, Hal itu dibuktikan oleh beliau, bahwasannya setiap berangkat dan pulang sekolah beliau rela berjalan kaki melewati jalan yang terjal dan masih berbatu. Walaupun jarak dan kondisinya seperti itu, beliau tetap memilih belajar di Madrasah Ibtidaiyah (MI) Kelet karena beliau memiliki pertimbangan bahwa guru-guru di MI tersebut betul-betul istiqomah dalam mengajar serta memang MI tersebut berkualitas se-Kecamatan Keling pada saat itu. Beliau masuk di MI Kelet langsung kelas II sehingga beliau hanya menempuh pendidikan di Madrasah tersebut selama 5 tahun dan lulus pada tahun 1957 M. Sesuatu yang bisa dijadikan teladan dan memang menakjubkan dari beliau adalah selama menempuh pendidikan SR dan MI beliau tidak pernah absen walaupun satu hari dan walaupun beliau dalam keadaan sakit.
Pendidikan beliau tidak hanya sampai di sini. Setelah beliau tamat MI Kelet, beliau langsung melanjutkan belajar agama di Ponpes Ngagel Tayu Pati pada tahun 1957-1959 yang pada waktu itu di bawah asuhan KH. Ali Ridlo dan K. Muhammad Sholih Al Hafidz. Di Pondok inilah nama beliau yang mulanya Hudun di tambah oleh K. Muhammad Sholih al Hafidz dengan nama Muhammad pada awal dan Abdul Ghoni pada akhir nama sehingga menjadi Muhammad Hudun Abdul Ghoni.
Ponpes Ngagel tersebut adalah peninggalan KH. Abdur Rohman dan merupakan satu-satunya Pondok Pesantren di Ngagel pada saat itu. Pada waktu menjadi santri baru di Pondok Pesantren ini beliau langsung ditunjuk oleh pengurus untuk bersedia menjadi ketua Pondok . Akan tetapi beliau tidak bersedia dan menolak sehingga pada akhirnya beliau diamanati menjadi wakil keamanan Ponpes. Selama belajar di Ponpes ini waktu-waktu beliau selalu diisi dengan mengaji dan memahami Al-Qur'an serta kitab-kitab salaf. Selain aktif dalam pengajian Ponpes, beliau juga belajar di Madrasah Ponpes Ngagel yang dimulai masuk di kelas 6 Ibtidaiyah.
Setelah lulus beliau melanjutkan sekolah di Madrasah Tsanawiyah pada Ponpes tersebut. Pada tahun ajaran saat itu, Madrasah tersebut mengalami kefakuman (tidak ada guru yang mengajar), tetapi dari pihak pengurus pun tidak menyatakan bahwa sekolah ditutup. Kondisi sekolah yang baru mengalami kefakuman ini tidak mempengaruhi beliau untuk bertindak seenaknya. Akan tetapi beliau tetap masuk sekolah dan tetap berada di ruang kelas walaupun sendirian, tidak ada guru yang mengajar dan walaupun teman-teman yang lain membujuk beliau untuk tidak masuk sekolah. Semua itu beliau lakukan Karena beliau menyadari bahwa semua itu adalah kewajiban murid untuk tetap masuk sekolah walaupun tidak ada guru yang mengajar. Selain itu beliau merasa harus bisa menjadi teladan yang baik bagi teman-teman yanglain karena beliau berstatus sebagai ketua kelas. Keadaan seperti itu beliau jalani selama 3 bulan. Dalam kurun waktu tersebut setiap hari para pengurus Madrasah selalu mengontrol murid-murid yang masuk dan tidak masuk sekolah. Di antara pengurus tersebut adalah K. Muhammad Sholih al Hafidz, KH. Ali Ridlo, K. Mas'ud dan KH. Abdulloh Muhajir.
Melihat kondisi seperti itu dan mempertimbangkan semangat beliau yang haus ilmu maka K. Muhammad Sholih menyarankan supaya beliau pindah untuk melanjutkan sekolah di Madrasah Matholi'ul Falah (MMF) Kajen Pati. Beliau pun langsung pindah sekolah di Matholi' seperti apa yang didawuhkan sang Kiai. Berhubung beliau masih mempunyai kegiatan mengaji kitab Ibnu Aqil secara khusus pada K. Mas'ud yang belum khatam maka beliau satu minggu sekali menyempatkan diri ke Ponpes Ngagel dengan naik sepeda onthel untuk meneruskan ngaji Ibnu Aqil pada K. Mas'ud sampai khatam. Adapun waktunya adalah Kamis sore dan Jum'at pagi, masing-masing dilakukan kira-kira 2 jam
Pada tahun 1959 M beliau pindah ke Madrasah Matholi'ul Falah (MMF) Pati Kajen. Beliau bermukim di Ponpes Matholi'ul Huda Ngemplak di bawah asuhan K. Muzayyin Haromain. Beliau masuk di kelas II Madrasah Tsanawiyah Matholi'ul Falah setelah lulus tes masuk bersama kedua temannya (Muhaimin putra KH. Ali Ridlo dari Ngagel dan Basuki dari Kediri). Sementara itu, kedua temannya yang ikut tes bersama beliau gagal (tidak lulus tes). Selama beliau duduk di bangku kelas II MTs hingga lulus kelas III MTs pada ajaran 1961-1962 M. teman-teman beliau tetap utuh sejumlah 57 orang. Seluruh teman tersebut beliau masih ingat dengan baik nama-namanya, mereka adalah :
1. Abdul Muhith
2. Abdullah
3. Abdul Kholid
4. Abdul Halim
5. Abdur Rohman
6. Abdul Hamid
7. Abu Amar
8. Abdullah
9. Abdul Jamil
10. Abdul Qohar
11. Hamzah
12. Hanafi
13. Hudun
14. Ilyas
15. Mustamir
16. Ismail
17. Kurdi
18. Denuri
19. Khazin
20. Muhsin
21. Masyhud
22. Muhammad
23. Sanusi
24. Muslih
25. Anas
26. Mudlolal
27. Mu’tashom
28. Nasihun
29. Nyaman
30. N. Rohmat
31. Sholihin
32. Sholeh
33. Sya’roni
34. Sholihan
35. Sukari
36. Suntawi
37. Tukahar
38. Thoha
39. Tamyiz
40. Zuhdi
41. Hamdan
42. Baidlowi
43. Baqir
44. Fauzan
45. Halimi
46. Ihsan
47. Mahfudz
48. Mukhtar
49. Syairozi
50. Muhtadi
51. Nuh
52. Rasyidi
53. Syarbini
54. Subaqir
55. Shodiq
56. Anwar
57. Mustari
Setelah lulus dari MTs Matholi'ul Falah, beliau didawuhi oleh K. Muzayyin Haromain untuk mengabdi mengajar di Madrasah Matholi'ul Falah (MMF) Kajen Pati tanpa melamar seperti pada umumnya. Peristiwa itu bersamaan dengan kerawuhan KH. Sahal Mahfudz dari Sarang. Beliau diberi tugas mengajar di Madrasah tersebut pada kelas V, VI Ibtidaiyah serta kelas I MTs Selama 4 tahun ajaran (1961-1962 s/d 1965-1966 M). Sewaktu beliau mengemban tugas sebagai pengajar di Madrasah Matholi'ul Falah, guru beliau yang berasal dari Ngagel yaitu Bapak Subki (guru umum) yang merupakan penilik sekolah se-Kawedanan Tayu sedang menilik di Madrasah Matholi'ul Falah. Akhirnya keduanya pun bertemu dan beliau langsung ditawari oleh Bapak Subki untuk bersedia diangkat menjadi guru agama tanpa diuji dan tanpa persyaratan. Akan tetapi beliau tidak bersedia menerima tawaran tersebut.
Selain mengajar di Madrasah Matholi'ul Falah, beliau juga menyempatkan diri untuk mengaji kitab-kitab salaf pada para Kiai yang berada di Kajen. Di antaranya, KH. Ahmad Sahal Mahfudz dan KH. Muhammadun. Dengan KH. Sahal Mahfudz beliau mengaji berbagai kitab diantaranya Fathul Wahab, Asybah Wan Nadhoir, Al Mahally, Tanbihul Ghofilin, Al Majalis Ats Tsaniyah, Ats-Tsamarat Al Hajiniyyah, Fathul Jawwad, Jam'ul Jawami', Dahlan Alfiyah, Bughyatul Mustarsyidin, Risalah Tanbihatul Wajibat Lihadlrotisy syeh Hasyim Asy'ari, Ibnu Aqil Al Asyhar dll. Di antara kesekian kitab yang dikaji, kitab yang terakhirlah yang paling berkesan bagi beliau karena hal-hal yang belum beliau pahami dalam kitab tersebut dijelaskan oleh KH. Sahal dengan baik sehingga beliau dapat memahaminya. Melihat kealiman KH. Sahal maka beliau termotivasi untuk melanjutkan belajar ke Ponpes Sarang.
Sewaktu mondok di Ngemplak tepatnya pada tahun 1964 M, beliau pernah menyarankan seseorang yang bernama Jono untuk bersedia mewakafkan tanah yang dimiliki untuk kepentingan Madrasah. Akhirya Pak Jono pun mengikuti apa yang disarankan beliau sehingga tanah tersebut diwakafkan dan di atasnya didirikan sebuah bangunan Madrasah diniyah. Kemudian Madrasah tersebut beliau beri nama dengan nama Madrasah Darun Najah.
Pada tahun 1966 M beliau meneruskan pengembaraan ilmu agama di Pondok Pesantren Sarang Rembang. Tepatnya pada Ponpes Ma'had Ulum Asy-Syar'iyyah (MUS). Seperti di Pondok-Pondok sebelumnya, beliau langsung ditunjuk menjadi wakil keamanan. Pada tahun berikutnya beliau di beri amanat menjadi seksi ma'arif (paling lama) serta juga pernah menjadi seksi ma'arif seluruh Ponpes sarang (MUS, MIS dan PMH), menjadi wakil sekretaris Madrasah Ghozaliyah serta juga pernah menjadi wakil mudir Madrasah Ghozaliyah yang diangkat oleh KH. Maimun Zubeir. Kebiasaan seperti diatas beliau alami mulai mondok di Ngagel sampai di Sarang. Setidaknya setiap masuk beliau selalu langsung ditunjuk menjadi ketua Pondok. Akan tetapi beliau pun tidak bersedia karena merasa masih santri baru dan belum banyak mengetahui situasi Pondok yang bersangkutan kecuali ketika beliau mondok di Ngemplak. Beliau bersedia ditunjuk menjadi ketua Pondok karena memang beliaulah santri pertama kali yang mondok di Pondok tersebut dan memang beliaulah yang paling sepuh.
Selama mondok di Sarang beliau mengkaji ilmu-ilmu agama dengan beberapa Masyayikh. Di antaranya adalah KH. Zubeir Dahlan, KH. Ahmad Syu'aib dan K. Imam Kholil. Bersama KH. Zubeir Dahlan beliau mengaji beberapa kitab diantaranya Ihya' Ulumuddin, Fathul Wahab, Al Mahally, Asybah Wan Nadhoir, Syarhul Hikam, Shohih Bukhori, Shohih Muslim, Tafsir Jalalain, Tafsir Baidlowi, Tafsir Ibnu Katsir, Jam'ul Jawami', Kifayatul Akhyar, Syudzurudz Dzahab, Tafsir Munir dan masih banyak lainnya. Untuk Tafsir Baidlowi beliau mengaji secara khusus dengan KH. Zubeir Dahlan bersama temannya yang bernama Abdul Hamid Baidlowi Lasem. Adapun kitab yang dikaji dengan KH. Syu'aib di antaranya adalah Irsyadul 'Ibad, Nashoihul 'Ibad, Sulam Tufiq, Bidayatul Hidayah dll. Sementara itu pada K. Imam Kholil beliau mengkaji kitab Irsyadul 'Ibad, Bidayatul Hidayah, Kasifatus Saja, dll.
Sewaktu masih mondok di Sarang, tepatnya pada tahun 1968 beliau meminta ijin untuk mengikuti pengajian kilatan Ramadlan Bukhori-Muslim di Mranggen Demak yang diqori' oleh KH. Muslih dan KH. Ahmad Muthohar secara bergantian. Pengajian tersebut dimulai tanggal 20 sya'ban s/d 20 Ramadlan pada pukul 06.00 s.d. Dhuhur. Setelah jama'ah Dhuhur dilanjutkan s.d. Ashar. Kemudian dilanjutkan sampai menjelang Maghrib. Setelah shalat Tarawih dilanjutkan sampai dengan pukul 01.00malam. Di Sarang pula beliau pernah melakukan puasa Dalailil Khoirot selama tiga tahun melalui ijazah dari KH. Ahmad Basyir pengasuh Ponpes Darul Falah Bareng Jekulo Kudus.
Pada tahun ajaran 1969-1970 M beliau ditunjuk oleh KH. Maimun Zubeir dan KH. Abdur Rohim Ahmad untuk mengajar di Desa Waru Paciran Lamongan. Hal itu untuk memenuhi permintaan H. Syuhada' yang menginginkan supaya santri sarang yang pernah mondok di Kajen untuk dikirimkan ke Waru Paciran Lamongan guna mengajar agama ala Ahlussunnah Wal Jamaah. Karena pada saat itu daerah tersebut baik masjid maupun Madrasah telah dikuasai oleh orang-orang Muhammadiyah. Pada saat itulah beliau merintis Madrasah ala Ahlussunnah Wal Jamaah. Kemudian sebagian kecil dari putra-putra tokoh masyarakat NU pindah ke Madrasah yang baru dirintis tersebut. Pada perkembangan selanjutnya lambat laun jumlah murid yang berada di Madrasah ala Ahlussunnah Wal Jamaah tersebut sedikit demi sedikit mengalami perkembangan jumlah murid yang signifikan. Pada akhirnya Madrasah tersebut sekarang sudah sebanding dengan Madrasah yang dikuasai orang-orang Muhammadiyah. Akan tetapi, beliau bertugas di Desa Waru tersebut hanya satu tahun. Setelah itu beliau kembali lagi ke Sarang pada tahun 1971 M. Hal itu karena beliau masih merasa berat untuk meninggalkan Pondok Sarang.
Pada tahun ajaran 1971-1976 beliau mulai berkhidmah mengajar di Madrasah Ghozaliyah Sarang di kelas V, VI Ibtidaiyah dan kelas I,II dan III MTs. Beliau mengajar di Madrasah Ghozaliyah Sarang selama 5 tahun. Pada Tahun Ajaran terakhir beliau mengajar di Madrasah Ghozaliyah Sarang beliau sudah berusia 42 tahun. Walaupun usia beliau sudah terbilang tua menurut kebanyakan masyarakat, namun beliau tetap masih berjiwa muda dan ingin melanjutkan pengembaraan ilmu serta tabarrukan pada ulama'-ulama' di Makkah Al Mukarromah. Akan tetapi sebelum beliau berangkat tabarrukan ke Makkah Al Mukarromah beliau menyempatkan diri mengikuti pengajian kilatan pada bulan Ramadlan di Ponpes Buntet Cirebon dengan Kiai Busyro dan Kiai Zaid.
Pada tahun 1967 M beliau pernah ditawari oleh Bapak Khadziq Siroj (asli Kajen) untuk menjadi pegawai Departemen Agama di kabupaten Blora. Hal itu disebabkan banyak pegawai Depag di beberapa Kabupaten mengalami kekosongan terutama KabupatenBlora. Akan tetapi, beliau tidak mau menerima tawaran tersebut dan akhirnya yang diangkat adalah Bapak Munir (Nur Sholihin), yaitu teman beliau sewaktu di Ngagel.
Pada bulan Desember 1976 M beliau berangkat tabarrukan ke Makkah Al Mukarromah. Beliau di sana mukim pada tempat KH. Hasyim Nawawi. Di sana beliau tabarrukan pada Sayyid Muhammad Al Maliki Al Makkiy dan Al Allamah Syekh Muhammad Yasin bin Isa Al Fadani. Selama di Makkah beliau akrab dengan Al 'Alim Al Mursyid K. Muhammad Sirojuddin dari Trenggalek Jawa Timur yang mulai mukim di Makkah setelah peristiwa Madiun. Dari K. M. Sirojuddin lah beliau belajar doa-doa ulama' ahli hikmah khususnya ijazah Kutubul Hikmah, di antaranya adalah ijazah Jaljalut Kubro dengan sanad Ilal Muallif dan sanad Bir Ru'ya As Sholihah. Pada waktu di Makkah beliau juga mengaji Al Quran bil Ghoib dengan Syeh Abdul Wahab Al Misra setelah sholat Ashar di Masjidil Haram.
Pada tahun 1983 M beliau pulang ke Indonesia dan ketika itu beliau telah berumur 50 tahun. Setelah tiba dari Makkah Al Mukarromah beliau bersilaturrahim di Cengkareng Jakarta kepada Dr. Abdul Kholiq (asli Bangsri), dan beliau hendak diangkat sebagai guru bagian rohani yang menangani para TNI di Jakarta. Akan tetapi, beliau tidak mau menerima tawaran tersebut.
Pada tahun tersebut beliau menikah dengan seorang gadis bernama Mahbubah putri dari Kiai Hafidhon Sumber Pancur Kepung Kediri. Setelah menikah beliau berniat untuk istiqomah di Desa Mantingan Jepara. Beliau memilih untuk istiqomah di Mantingan atas petunjuk sebagian guru supaya beliau istiqomah di desa tersebut. Hal itu dikarenakan pada desa tersebut ada makam seorang Waliyulloh dan disitu belum ada Pondok Pesantren. Setelah beliau memutuskan untuk istiqomah di Desa Mantingan maka beliau lebih mendahulukan mengembangkan ilmu daripada membangun kekuatan ekonomi. Hali itu beliau lakukan karena memang merupakan petunjuk dari sebagian guru belaiu. Akhirnya beliau mulai membangun biduk rumah tangga dalam posisi belum memiliki apa-apa, semuanya dimulai dari nol. Dari pernikahan tersebut beliau di karuniai 7 orang anak yaitu : Hafidloturrobi'ah, Muhammad Sholahuddin, Lailaturrohmah, Haniatur Rohmaniyah (meninggal dunia pada umur 53 hari), Aan Hasanah, Ainur RofiqohdanFathimah Azzahro(meninggal dunia pada umur 10 hari).
Sewaktu bertempat tinggal di Mantingan beliau mulai mengajar mengaji dengan meminjam tempat sementara di Ponpes Darul Ulum Mantingan yang ketika itu merupakan sebuah gedung Ranting NU desa tersebut. Dalam mengajar di Ponpe tersebut beliau tidak mau menguasai (tidak bertanggung jawab atas kerusakan bangunan) dan tidak ingin dikuasai (tidak ingin diberi uang atas nama mengajar). Beliau mengajar di Ponpes tersebut selama 5 tahun (tahun 1983-1987 M). Di Ponpes tersebut beliau mengajarkan Al Qur'an dan kitab-kitab salaf. Di antaranya adalah :
الاجرومية
متممة الاجرومية
إبن عقيل
فتح المعين
هداية الصبيان
بدائع الزهور
الكواكب اللماعة
سفينة النجا
سلم التوفيق
تيجان الدراري
فتح القريب
عقود اللجين
رياض البديعة
منهاج القويم
نصائح العباد
إرشاد العباد
المجالس السنية
العصفورية
تفسير يس
متن الجزرية
الزبد
القران الكريم
التحرير
بلوغ المرام
لب الاصول
تفسير الجلالين
فتح المجيد
الحصون الحميدية
ابي جمرة
Setelah tiga tahun beliau mengajar di Popes tersebut dan belum adanya keberhasilan sesuai yang beliau harapkan, maka beliau berusaha meminta ijin pada para pengurus Pondok untuk berpindah. Akan tetapi para pengurus belum memberikan ijin. Selang satu tahun berikutnya beliau berusaha meminta ijin kembali akan tetapi pihak pengurus pun masih tetap masih tidak mengijinkan beliau untuk pindah.akhirnya satu tahun kemudian beliau minta ijin kembali dan para pengurus pun mengijinkan beliau untuk berpindah.
Akhirnya beliau memilih untuk pindah di tanah Pengladenan Mantingan dengan membeli sebidang tanah. Di tanah tersebutlah beliau merintis sebuah pendidikan Pondok Pesantren dan Madrasah dengan model sekolah (klasikal). Pendidikan yang beliau harapkan adalah pendidikan yang mengutamakan kualitas, mengedepankan mengejar faham, pelajaran dimulai dari nol, pelajaran disesuaikan dengan ukuran kecerdasan masing-masing (biqodri uqulihim), hafalan bukan syarat kenaikan kelas tetapi harus hafal terus, dan santri harus mampu praktek mengajar ilmu yang telah dipelajari. Pondok yang beliau rintis diberi nama Pondok Pesantern Salaf Modern Nurul Huda. Pendidikan Madrasah Pondok Pesantren tersebut berjenjang 6 tingkat. Sebelum ada murid pada Madrasah Pondok tersebut sang Kiai telah menyiapkan 8 orang guru, yaitu Syaikhina KH. M. Hudun Abdul Ghoni, Ust. Ahmad Mufid (Mantingan), Ust. Syamsul Huda (Saripan Jepara), Ust. Farhanuddin (Demaan), K. Munja'i Umar (Menganti), KH. Mahfudh Shiddiq (Menganti), KH. Abdurrafiq Amir, L.c (Bugel), Ust. Khufadzi (Surodadi).
Pada Madrasah tersebut masing-masing tingkat memiliki kewajiban menghafal sesuai dengan tingkatannya. Santri tingkat satu dan dua memiliki kewajiban menghafal kitab Matan Jurumiyah, Al Amtsilatut Tashrifiyah, Qowa'idul I'lal, dan I'lal. Adapun santri tingkat tiga sampai enam memiliki kewajiban meghafal nadhom Alfiyah Ibnu Malik sebanyak 1000 bait dengan rincian tingkat tiga harus hafal 350 bait, tingkat empat 600 bait, tingkat lima 800 bait, dan tingkat enam 1000 bait. Semua hafalan tersebut harus terus dirawat (hafal terus) walaupun telah melewati jenjang tingkatan sekolah. Semua itu adalah program dari pengasuh guna mewujukan pendidikan yang berkualitas seperti cita-cita beliau. Pada Tahun Ajaran pertama tingkat pertama masuklah santri sejumlah 18 orang. Akan tetapi, yang bisa bertahan sampai lulus di tingkat enam (tahun ajaran 1412-1413 H/1991-1992 M) hanya ada 2 orang santri yaitu Muhammad Musyaffa' dari Bonang Tridonorejo Demak dan Sulis Amin dari Sendang Mantingan Tahunan Jepara.
Pada Tahun Ajaran 2005-2006 M Madrasah Pondok Pesantren Nurul Huda pernah mengadakan takhassus fiqh yang diikuti oleh seluruh santri yang sudah tidak sekolah. Hal tersebut untuk mengisi kekosongan pada tingkat enam. Karena kebetulan pada tahun ajaran tersebut tingkat enam kosong.
Pada Tahun Ajaran 2007-2008 M Madrasah Pondok Pesantern Nurul Huda menambahkan jenjang pendidikan menjadi 9 tingkatan (tingkat VII,VIII dan IX). Sistem pada tingkatan-tingkatan tersebut adalah seluruh kitab dibaca oleh para santri, guru tinggal mendengarkan. Apabila ada kesalahan guru tinggal meluruskan. Bila santri menemukan kesulitan dalam hal memberikan makna atau memahami mereka diharuskan melihat kamus serta memusyawarohkannya dengan teman-temannya. Bila belum terpecahkan baru ditanyakan pada guru pengampunya. Santri dituntut untuk langsung faham pada setiap pelajaran, Kitab-kitab yang diajarkan di setiap tingkatan. Sehingga seandainya para santri tingkat tujuh sudah naik ke tingkat delapan harus berani ditugaskan untuk mengajar tingkat tujuh, dan santri tingkat delapan yang sudah naik ke tingkat sembilan harus berani ditugaskan mengajar ditingkat delapan, dan santri yang sudah lulus dari tingkat Sembilan harus mampu dan berani ditugaskan mengajar ke Madrasah-Madrasah maupun Pondok Pesantren maju manapun. Selain hal tersebut yang terpenting adalah santri pada tingkatan-tingkatan tersebut harus mampu mengamalkan ilmu yang telah dicapai sesuai dengan kemampuan masing-masing. Guna merealisasikan tujuan baik itu, beliau selalu memantau, membimbing, dan mengawasi para santri supaya betul-betul melaksanakan dan mewujudkan nilai luhur tersebut, baik selama masih di Pondok Pesantren maupun sudah menetap di tempat tinggal masing-masing.
Adapun guru-guru yang mengajar pertama kali pada tingkatan tersebut berjumlah 4 orang guru. Beliau-beliau adalah Syaikhina KH. M. Hudun Abdul Ghoni, Ust. Roshif Arwani (Babalan Wedung Demak), Ust. Hanbali (Belik Godrak Tubanan Pekalongan Batealit Jepara), Ust. Mutholib al-Fasiri (Demaan Jepara).
Pada pembukaan tingkat tujuh santri yang masuk sejumlah 20 orang. Pada tahun ajaran 2009-2010 M/1430-1431 H Madrasah Nurul Huda mewisuda pertama tingkat Sembilan dengan jumlah siswa 18 orang. Hal tersebut disebabkan karena satu santri yang bernama Budi Kesmono dari Desa Carikan Kayen Pati meninggal dunia pada hari Jum'at Legi Tanggal 27 Shofar 1431 H./12 Februari 2010 M. dan yang satu bernama Muhammad Jamaluddin dari Bawu Batealit Jepara. Ia keluar pada saat akhir tingkat delapan (karena sakit).
Para santri di Pondok Pesantren Nurul Huda tersebut diberikan kegiatan-kegiatan secara rutin. Di antaranya adalah mengaji Al-Qur'an setiap pagi setelah jamaah sholat Shubuh (selain hari Selasa dan Jum'at), mengaji kitab-kitab salaf, sekolah, melaksanakan aurod-aurod yaitu Rotibul Haddad setiap hari ba'dal Maghrib, Asmaul Husna dan Surat Yasin setiap hari setelah Shubuh, Surat Tabarok dan Waqi'ah setiap malam Selasa ba'dal Maghrib, Qosidah Burdah setiap Jum'at ba'dal Maghrib, Sholawat Nariyah setiap Jum'at ba'dal Isya', Khitobiyah setiap Jum'at ba'dal Isya', belajar wajib setiap hari setelah jama'ah Sholat Ashar (selain yang belajar mengikuti pengajian kitab atau sekolah Wajar Dikdas dan Paket C). Musyawaroh sesuai tingkatan masing-masing setiap hari ba'dal Maghrib dan ba'dal Isya', Mujahadah ba'dal Isya', serta Muhafadloh (setiap hari ba'dal Isya', sebelum masuk sekolah dan setiap Selasa danJum'at pagi).
Adapun jadwal mengaji kitab-kitab salaf setiap hari adalah sebagai berikut :
WAKTU SABTU AHAD SENIN
Setelah Shubuh
06.00 – 07.00 القران الكريم القران الكريم القران الكريم
07.00 – 08.00 اسعاد الرفيق
جواهر البلاغة شرح إبن عقيل جمع الجوامع
Setelah Magrib
19.00 – 20.00 فتح المعين فتح القريب ارشاد العباد
20.00 – 20.30 الاشباه والنظائر
WAKTU SABTU AHAD SENIN
Setelah Shubuh
06.00 – 07.00 تفسير الجلا لين القران الكريم القران الكريم
07.00 – 08.00 إحياء علوم الدين إحياء علوم الدين
Setelah Magrib
19.00 – 20.00 فتح الوهاب كفاية الاخيار
Kitab-kitab yang pernah dipelajari oleh Syaikhina sudah beliau baca kurang lebih 95% dan semua risalah terbitan dari Petuk sudah pernah dibaca oleh beliau. Di antara kitab-kitab yang pernah dipelajari dan diajarkan para santri di Ponpes Nurul Huda adalah sebagai berikut :
ابن عقيل
ابي جمرة
احياء علوم الدين
بغية المسترشدين
بلوغ المرام
البيقونية
المجالس السنية
مجموع شريف
المختصر الشافي
شرح مختصر جدا
تاريخ النبي
الكواكب الدرية
كفاية الاخيار
كفاية العوام
الاعراب
الاعلال
الاذكار
الاربعين النووية
بداية الهداية
متن العوامل
العوامل الجرجاني
غاية الوصول
فتح الخبير
فتح الجواد
الديرابي
تسهيل نيل الاماني
هداية المستفيد
اعراب شواهد
ابن عقيل
فتح الوهاب
جوهرة التوحيد
الحصون الحميدية
تفسير حمامي زادة
درة الناصحين
الدسوقي
متن الرحبية
تجريد الصريخ
متن تعليم المتعلم
شرح تعليم المتعلم
تحفة الطلاب
التنقيح
كفاية الاتقياء
تفسير المنير
الميزان الكبرى
كفاية الغلام
الكفراوي
متن الجزرية
اسعاد الرفيق
ارشاد العباد
الاشباه والنظائر
الاقناء
ايضاح المبهم
الباجوري بردة
بدائع الزهور
خلاصة نور اليقين
المحاورة الحدثية
عشماوي
منهاج الطالبين
فتح المعين
قامع الطغيان
قطر الغيث
قطر الندي
كاشفة السجا
تنبيه الغافلين
تيجان الدراري
جمع الجوامع
تفسير الجلالين
جواهر المكنون
جواهر الكلامية
رسالة المعاونة
رياض البديعة
رياض الصالحين
رسالة ستين مسألة
سلم المناجاة
سلم المنورق
صحيح البخاري
العصفورية
خزينة الاسرار
منبع الحكمة
عقود الجمان
عقود اللجين
جواهر البلاغة
فيض الخبير
الثمرات الحاجينية
مصطلح التجويد
الامثلة التصريفية
القواعد الصرفية
الاربعين النووية
دروس الفقهية
العقائد الدينية
تحفة الاطفال
شرح المحلي
شمس المعارف
فتح القريب
قرائة الرشيدة
الانشاء من كلام البلغاء والنحاة
جواهر البخاري
اعانة الاصحاب
القران الكريم
دقائق الاخبار
سفينة النجا
سلم التوفيق
ابردة
الزبد
عنوان الظرف
لطائف الاشارات
اللمع
متممة الجرومية
متن الجرومية
الفية ابن مالك
شذور الذهب
شرح الحكم
الكيلاني
منهاج العابدين
مدارج السعود
مغني اللبيب
العمريطي
المواهبالصمد
نصائح الدينية
منهاج القويم
نصائح العباد
نظم الا جرومية
نهاية الزين
نور الظلام
الورقات
عقيدة العوام
فتح الاقفال
الاخلاق للبنين
فتح المجيد
الفرائد البهية
روائع البيان في تفسير ايات الاحكام
حسن الصياغة
اعانة الطلاب
GURU-GURU DAN MASYAYIKH KH. M. HUDUN ABD. GHONI
Guru-guru di Madrasah Ibtidaiyah Kelet Keling Jepara :
1. Ust. Imam Shobari
2. Ust. Mustajab
3. Ust. Jamhari
4. Ust. Zuhdi
5. Ust. Hasan Fadloli
Guru-guru dan Masyayikh di Ponpes, Madrasah Ibtidaiyah dan Tsanawiyah Ngagel Tayu Pati :
1. K. M. Sholih Al-Hafidz
2. KH. Ali Ridlo
3. K. M. Mas'ud
4. KH. Abdullah Muhajir
5. K. Musyaffa'
6. KH. Syarif
7. Ust. Munawir
8. Ust. Zuhdi
9. Ust. Ma'shum
10. Ust. Muhyiddin
11. Ust. Subhi
12. Ust. Yusuf
13. Ust. Yazdi Sanjoyo
Kiai-Kiai, Guru-guru di Madrasah Matholi'ul Falah (MMF) Kajen Margoyoso Pati :
1. K. Muhammadun.
2. K. Abdul Hadi
3. K. Ahmad Rifa'i Nashuha
4. K. Ahmad Sahal Mahfudz
5. K. Muzayyin Haromain
6. K. Muzajjad
7. Ust. Juremi
8. Ust. Tamamuddin Munji
9. Kh. Hanbali
10. Kh. Ahmad Baidlowi
11. K. Faqih
12. K. Ahmad Hanziq Siroj
13. Kh. Anshori
14. K. Katsir
15. K. Zahwan Anwar
16. K. Abdullah Salam
17. K. Ahmad Fayyumi Munji
Masayikh di Ponpes Sarang Rembang :
1. Kh. Zubeir Dahlan
2. Kh. Ahmad Syu'aib
3. Kh. Imam Kholil
4. Kh. Ali Masyfu'
5. Kh. Musa
6. Kh. Syarif
7. K. Zahid
8. Kh. Maimun Zubair
9. Kh. Abdur Rohim Ahmad
10. Kh. Hasbulloh Babak
11. Ust. Muthi'
12. Ust. Musytari
Masyayikh di Makkah Al Mukarromah :
1. Al Allamah Al Sayyid Muhammad 'Alawy Al Maliki Al Hasani Bi Makkah Al Mukarromah
2. Al Allamah 'Alamuddin Abul Fadl Muhammad Yasin Bin Isa Al Fadany Al Makky Bi Makkah Al Mukarromah
3. As Syaikh Abdul Wahhab Al Mishro Bi Makkah Mukarromah
4. As Syaikh Al Mursyid Muhammad Sirojuddin Trenggalek Bi Makkah Al Mukarromah
Masyayikh-masyayikh Tabarrukan Fi Romadlon Wa Ghoirihi :
1. Al Allamah Kh. Mushlih Ibnu Abdurrohman Mranggen Demak
2. Al Allamah Kh. Ahmad Muthohar Ibnu Abdurrohman Mranggen Demak
3. K. Busyro Buntet Cirebon
4. KH. Ahmad Basyir Bareng Jekulo Kudus
5. As Syaikh Al Mursyid Al Alim K. Nur Said Mororejo Panceng Gresik
6. K. Habib Mushthofa Sepanjang Surabaya
7. As Syaikh Al Mursyid Kh. Hasbullah Kembang Dukohseti Tayu Pati
8. K. Zaid Buntet Cirebon.
Pada hari Ahad Pahing, tanggal 7 Jumadil Ula 1435 H / 9 Maret 2014 M, kurang lebih pukul 14.45 WIB di usia + 81 tahun dan meninggalkan keluarga yaitu :
Istri : Nyai Mahbubah
Anak : 1. Hafidhotur Robi’ah
M. Alif Alina (Menantu)
Asma’ Zahrotus Syita’ Al Hana’ (Cucu)
2. M. Sholahuddin
Siti Nuzulun Ni’mah (Menantu)
3. Lailatur Rohmah
Muhammad Ghozi Abdul Rohman (Menantu)
4. Aan Hasanah
Ahmad Prayitno (Menantu)
Ahmad Fathoni (Cucu)
5. ‘Ainur Rofiqoh
Setelah wafatnya KH. M. Hudun Abdul Ghoni, sekarang Pondok Pesantren Salaf Modern Putra-Putri “Nurul Huda” Mantingan Tahunan Jepara di teruskan oleh Putranya yang bernama M. Sholahuddin dan di bantu oleh para Menantu yaitu Muhammad Ghozi Abdul Rohman (Balong Kembang Jepara) & Ahmad Prayitno (Kecapi Tahunan Jepara) dan para Asatidz.
#syaikhina